Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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