Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pcsk9Q80W65 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Pcsk9Q80W65 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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