Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pnma8aQ80VM8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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