Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Dsg1bQ7TSF1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Dsg1bQ7TSF1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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