Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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