Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms