Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms