Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sys1Q78S06 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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