Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1cQ76I25 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms