Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms