Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AcanQ61282 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms