Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hcfc1Q61191 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms