Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms