Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med13Q5SWW4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms