Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms