Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms