Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Shroom4Q1W617 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms