Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rpusd2Q149F1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rpusd2Q149F1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rpusd2Q149F1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rpusd2Q149F1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rpusd2Q149F1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rpusd2Q149F1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rpusd2Q149F1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rpusd2Q149F1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rpusd2Q149F1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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