Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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