Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms