Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Cnn1Q08091 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Cnn1Q08091 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms