Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fgfr4Q03142 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms