Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms