Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb4Q02738 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms