Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms