Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgcrQ01237 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms