Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NficP70255 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NficP70255 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NficP70255 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NficP70255 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NficP70255 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NficP70255 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NficP70255 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NficP70255 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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