Protein–RNA interactions for Protein: P58283

Rnf216, E3 ubiquitin-protein ligase RNF216, mousemouse

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Length 853 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf216P58283 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf216P58283 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf216P58283 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms