Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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PtpreP49446 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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