Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VdrP48281 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms