Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms