Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mmp9P41245 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mmp9P41245 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mmp9P41245 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mmp9P41245 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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