Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc11P31313 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms