Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtmaP26350 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms