Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NdnP25233 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms