Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P20040 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P20040 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P20040 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P20040 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P20040 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
P20040 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P20040 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P20040 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P20040 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P20040 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P20040 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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