Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18529 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18529 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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