Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtpraP18052 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtpraP18052 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtpraP18052 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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