Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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