Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms