Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa5P09021 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms