Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06330 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P06330 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P06330 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P06330 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06330 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P06330 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P06330 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P06330 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P06330 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P06330 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P06330 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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