Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cops6O88545 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cops6O88545 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cops6O88545 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cops6O88545 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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