Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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