Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Inpp5k-201ENSMUST00000006286 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Mill2-206ENSMUST00000228493 2043 ntAPPRIS P4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Scnn1a-207ENSMUST00000177329 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms