Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms