Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms