Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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