Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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