Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms